急性胃肠炎的确诊需要根据症状、体征以及实验室检查结果明确。该疾病常见的临床表现就是腹泻，每日大便的次数达10余次，可能会出现蛋花汤样大便。同时也可能会出现食欲下降、恶心、呕吐等症状。
如果有出现低钾血症，还可能会出现腹胀以及全身中毒症状。部分患者还可能会出现反复的发热、食欲不振、烦躁不安。通过做腹部的体格检查，可能会出现脐周的压痛以及反跳痛。
实验室检查主要是大便常规检查，以及大便的培养检查。同时可能也需要做血细胞计数的检查，可以明确该疾病的诊断。