肥胖症是会导致身体内分泌紊乱的。肥胖症本身就属于一种代谢性疾病，可以引起体内诸多代谢过程的紊乱，比如血糖代谢、血脂代谢等，这两种代谢的紊乱，会干扰内分泌激素的水平，从而导致内分泌紊乱。
而内分泌紊乱又会反过来加重肥胖症，比如当体内甲状腺激素水平过低，或糖皮质激素水平过高的时候，肥胖症也会出现，因为内分泌激素中有很多都与脂肪的代谢有着明确的相关性。
所以肥胖本身与内分泌系统是存在着不可分割的联系的，二者互为因果关系。