内分泌失调是可以引起肥胖的。人的大脑是最高司令部，内分泌失调患者常常合并有继发性肥胖症，下丘脑有人体摄食中枢，当内分泌紊乱时，下丘脑的摄食中枢不像平时那样正常工作了。
正常时人在非饥饿状态下即使有食物放在面前也不会摄食，这与下丘脑摄食中枢的作用直接相关，但是当内分泌失调时，此过程亦会受到影响，患者表现为食欲亢进，从而引发继发性肥胖。
此外，当各种原因下丘脑-垂体-肾上腺轴任一环节出问题，导致糖皮质激素水平升高时，也可出现向心性肥胖，表现为躯体和面部肥胖，而四肢消瘦。