肥胖症不太容易引起内分泌失调，主要引起的是代谢紊乱性的疾病，例如出现糖代谢的紊乱、血脂代谢的紊乱、尿酸代谢的紊乱等等，所以肥胖症的患者很多合并有代谢紊乱性的疾病。
相反的是有些内分泌失调的疾病，可以引起肥胖症，比如甲减的患者可以出现肥胖、库欣综合征的患者可以出现肥胖。女性绝经期以后以及一些多囊卵巢综合征的患者，也可以出现肥胖。
肥胖症除了会引起代谢紊乱以外，还造成许多疾病的治疗困难。因此，积极的控制体重是非常重要，还有就是现在儿童肥胖也成为了现代社会的严重的卫生问题。