多数情况下，假膜性肠炎是可以治愈的，并且很多轻症的，也有可能自己就会痊愈。
对于假冒性肠炎比较严重的患者，首先就是停用之前不合理的使用抗生素，并且及时的进行大便检查，发现是否有梭状芽孢杆菌，如果一旦确诊，就可以使用甲硝唑、万古霉素等药物来进行治疗。
还要注意假膜性肠炎导致的腹泻而引起的并发症，如脱水、电解质紊乱、酸中毒等，所以在必要的时候也应该及时的进行纠正的，并且注意存在很多慢性疾病出现假膜性肠炎的，如体质虚弱的患者、抵抗力下降的患者、有糖尿病等基础疾病的患者，恢复可能会受到一定的影响。