舌下腺囊肿属于唾液腺粘液囊肿，根据其病因和病理表现的不同，可以分为外渗性粘液囊肿和潴留性粘液囊肿。
一、外渗性粘液囊肿占粘液囊肿的80%以上，组织学表现为粘液性肉芽肿或充满粘液的假囊，无上皮衬里。许多研究表明，外渗性粘液囊肿的发生系导管破裂渗液外漏组织间隙所致，还有粘液的囊样腔样有间隙，由结缔组织和肉芽组织的衬里，这提示外渗性粘液囊肿是由创伤引起。
二、潴留性粘液囊肿远不如外渗性粘液囊肿常见，组织学表现有三个特点，有上皮衬里潴留的粘液团块及结缔组织的被膜。潴留型粘液囊肿的发病原因主要是导管系统的部分阻塞，可由微小涎石、分泌物浓缩或者导管系统弯曲等原因所致。