慢性胆管炎可以口服的消炎药物，有三代头孢菌素类药物以及抗厌氧菌药物，可以选择头孢地尼、头孢克肟以及替硝唑等药物来促进疾病的缓解。
如果患者反复出现腹痛，以及恶心、呕吐等症状，还可能需要给患者使用消炎利胆药物、抑制胃酸分泌的药物，极少部分的患者还可能需要使用免疫抑制剂。
如果通过非手术治疗的方式症状没有得到控制，容易反复发作时，应该要及时地手术治疗。通过手术治疗可以去除胆管梗阻因素，使胆道引流通畅。