食管囊肿也有可能导致胃部不舒服的，因为食管与胃是相连的。所以，食管囊肿有可能导致吞咽困难，或者吞咽的疼痛，以及引起继发感染，这种情况下都有可能导致胃部的不舒服的。
所以，针对食管囊肿的患者，还是需要积极的进行治疗的。如果出现胃部不舒服的症状，也应该及时的检查。
除了食管囊肿导致胃部不舒服以外，更要考虑胃炎、胃部的占位性疾病、溃疡病等，导致胃部不舒服的几率更大一些。所以，在必要的情况下，也应该进行相关的检查。