肛瘘瘘管形成脓肿是比较严重的。肛瘘分为低位肛瘘和高位肛瘘，肛瘘的瘘管形成脓肿这种情况比较严重，需要及时做手术，找到瘘管的内口。特别是复杂性的高位肛瘘，可能存在有多条瘘管，在做手术时要把瘘管和内口完全切除。
如果是高危性的肛瘘，可行挂线术，避免损伤肛门括约肌。手术后再静脉点滴头孢类的抗生素抗感染治疗，伤口部位要塞入引流条，避免出现假性愈合，并每天对伤口进行消毒和换药。
肛瘘瘘管形成脓肿是比较严重的，如果不及时处理，有可能会导致感染更严重。