该疾病的治疗主要是根据患者的临床表现给予用药治疗，包括口服镇静解痉药物，或者是舌下含服硝酸甘油片等，也可以使用钙拮抗剂缓解症状。
在睡觉时可以使用高枕或者将头部垫高，可以防止睡眠时食物逆流入呼吸道。最主要的治疗方式，可能是手术治疗，包括经内镜治疗以及开腹手术治疗。
大部分的患者通过经口内镜下肌切开术后，吞咽困难可以得到明显的缓解，而且反流性食管炎的发生率较低，是目前治疗该疾病的最佳选择。部分患者如果在使用传统内镜下治疗效果不佳时，可能需要进行开腹手术。