感染了汉坦病毒后，不一定会发生肾综合症出血热。感染病毒后大部分人会发病，但有少部分人呈隐性感染，不发病。人群普遍易感，但以青壮年、农民多见，儿童发病极少见。肾综合征，又称为流行性出血热，潜伏期8到39天，一般为两周，约10%到20%的患者有前驱症状，表现为上呼吸道卡他样症状，比如咽痛、咳嗽，或者胃肠道功能失调表现。
肾综合症出血热临床上可分为发热期、低血压期、少尿期、多尿期、恢复期五期。但这五期也经常有交叉重叠现象。