睡醒了头疼的原因大致包括以下两个方面：
1.由于睡眠质量不好导致。睡觉过程中多种不良因素干扰，导致深度睡眠时间过短、浅度睡眠时间过长，大脑神经没有得到有效休息，虽然睡醒了但是睡眠质量不好，机体就容易出现头疼症状。建议及时查找原因，尽早给予纠正。
2.由于错误的睡觉姿势，导致颈部、枕部或者大脑颞叶部位的血管受压，大脑因供血不足表现出头疼症状。建议及时纠正不良的睡觉习惯，遵医嘱给予对症调理或者治疗。