吃栀子金花丸，小便发黄属于正常现象，原因是热邪从尿道排出，所以小便会发黄。中医理论讲黄色的小便属于一种排热的反应，也可能是这些中药颜色发黄，所以代谢产物从尿道排出也发黄。
栀子金花丸的药物组成有：栀子、黄连.、黄芩、黄柏、大黄、天花粉、金银花、知母等。而这其中金银花、黄柏、黄芩、黄连等这些中药颜色都发黄，经肾脏代谢后，尿液也会发黄。另外，维生素B2服用后，尿液也会发黄。
栀子金花丸的主要功效是清热泻火与凉血解毒，主要用于治疗肺胃热盛、口舌生疮、牙齿肿痛、咽喉肿痛以及大便秘结等。