肝结核的诊断，需要根据疾病的病史以及疾病临床表现，相关的实验室检测结果来判定。
疾病病史主要是患者有受到结核分枝杆菌感染的病史，比如既往有肠结核或者肺结核等疾病。临床表现主要是出现上腹部的疼痛，并且有结核中毒症状。实验室检查结果主要是做肝穿刺检查、细菌学检查、肝功能检查。
如果有出现肝功能的异常，并且通过血培养有出现结核分枝杆菌感染，做肝穿刺活检有出现粟粒性病变时，对于疾病的诊断有很大帮助。