长期头痛不治疗就会导致长期的头痛存在，有可能会进一步发展为其他病变。主要是看什么原因导致的头痛，比如只是神经性的头痛长期不治疗，也只是长期发生头痛而已。
如果有颅内肿瘤引起的头痛不治疗，肿瘤就会越长越大，最后会导致肿瘤扩散，引起全身性的肿瘤，引起死亡。有些头痛有可能是大脑炎症导致，如果不治疗炎症会继续加重、蔓延，有可能会导致全身的脓毒血症，并且炎症会导致颅内压升高，还有可能会导致脑疝发生，甚至引起死亡。
所以，头痛不治疗有可能会自愈自己好转，有的会出现加重导致死亡，具体要看是什么原因引起的头痛，有没有器质性的病变。