腘窝囊肿能够热敷，通过热敷能够改善酸胀、疼痛等不适症状，但是并不能够治愈腘窝囊肿。
如果腘窝囊肿没有引起任何临床症状，可定期观察。如果引起的临床症状较轻，可先进行保守治疗。通过针刺抽取的方法将囊内的积液抽取干净，然后再向囊内注射皮质类固醇药物，能够减轻粘连，消除囊肿。
如果保守治疗没有效果或者是症状比较严重的腘窝囊肿，可考虑进行手术治疗。主要包括关节镜手术以及传统的腘窝囊肿切除术。腘窝囊肿经过合理的治疗，大多数都能治愈。