呼吸衰竭常见的并发症有以下几大类：
因病情的不同，其并发症也有不同，严重的呼吸衰竭可以继发肺性脑病，多见于二型呼吸衰竭的进一步加重时，患者可以出现精神、神志的异常改变，甚至因此出现嗜睡、昏迷。
其次，是心脏相关的并发症，患者可以并发肺心病、心律失常、心力衰竭等，此时可以出现相关的临床表现，特别是心衰患者可有尿少、双下肢的浮肿、腹胀、喘闷加重等现象。此外，还可以有电解质酸碱平衡紊乱。
呼吸衰竭进一步加重时，可以继发其他器官功能的损害或衰竭，例如肾功能衰竭和消化系统的功能障碍等，患者有可能会出现消化道出血、消化不良等现象。故在呼吸衰竭的治疗同时，还要防治上述的并发症。