当子宫内膜腺体及间质侵入子宫肌层时称子宫腺肌症。多发于30到50岁经产妇，约15%同时合并内异症，约半数合并子宫肌瘤。它的治疗应视患者的症状年龄和生育要求而定。目前没有根治的有效药物。对于症状较轻，有生育要求及近绝经期患者可适用达那唑，孕三烯酮，曲丙瑞林，亮丙瑞林或左炔诺孕酮宫内缓释系统治疗均可缓解症状。但需要注意药物的副作用，并且停药后症状可以再次出现。在使用曲丙瑞林或者亮丙瑞林时应注意患者骨丢失的风险，可以给予反向添加治疗和钙剂补充。年轻或希望生育的子宫腺肌瘤患者，可行病灶切除术，但术后有复发的风险。对症状严重无生育要求或者药物治疗无效的患者，应行全子宫切除术。是否保留卵巢取决于卵巢有无病变和患者的年龄。