鼻拭子和咽拭子的主要区别是，采取不同部位的分泌物进行检测。
前者指的是进行鼻黏膜部位的分泌物检查，在患者取分泌物时，不会对咽喉部造成明显的刺激，一般不会出现恶心、呕吐等症状。后者指的是进行咽喉部分泌物的检测，在患者取分泌物时，需要对咽喉部取材，所以会造成明显的刺激，部分患者可能会出现明显的恶心、呕吐等表现。
鼻拭子和咽拭子都是对新冠病毒进行的核酸检测，如果出现有检测阳性结果，说明患者感染新冠病毒的可能性比较大，需要及时进行隔离。如果患者有明显症状，需要尽快治疗。