肛瘘与便秘关系不大。
肛瘘是肛管或直肠或者会阴皮肤相通的感染性通道，可流出血性、脓性分泌物、有异味，是肛周脓肿破溃或切口引流不畅的后遗症。主要由内口、瘘管、外口三部分组成，内口和外口可以有多个。而便秘指的是排便次数减少、排便量减少、大便硬结、不容易排出。
包括功能性和器质性两方面，功能性原因多与不良排便习惯、不良饮食习惯及精神心理因素有关，例如长时间蹲便和没有按时排便的习惯，爱吃辛辣刺激食物。器质性原因主要是指能引起便秘的一些原发病，例如直肠前突、直肠肿瘤等。