亚健康的起因有很多，主要有长期过度紧张、疲劳、压力大、睡眠不佳、生活作息不规律、营养失调等。
由于工作、生活等各方面的原因，有的人经常熬夜、加班，生活作息不规律，过度透支身体的机能，心理压力大，精神压力大，身体和心理长期处于过度疲惫和紧张的状态，得不到有效的缓解，伴随睡眠不佳，身体各组织器官得不到充分的休息和调理，造成各器官功能的过度消耗，身体抵抗力下降，导致亚健康症状出现。
饮食方面如果营养不均衡，长期营养不良或者长期摄入高脂肪、高蛋白、高热量的食物过多，都会导致身体的功能下降，引起亚健康症状的出现。