目前治疗抑郁失眠的药物较多，有的药物在治疗抑郁的同时具有改善睡眠的作用，例如常用药物有米氮平片、阿戈美拉汀、多塞平、曲唑酮等药物。也有在使用抗抑郁药物同时使用改善睡眠的药物，例如常用的有阿普唑仑、劳拉西泮、艾司唑仑、右佐匹克隆、唑吡坦等药物。
有些抑郁难治性失眠也可能会用到抗精神病药物，例如喹硫平、奥氮平等药物。
所以，抑郁失眠药物的选择，需要医生根据临床表现和个体差异等综合因素进行选择。