中药治疗赤痢的方法是先辨证再施治，赤痢属热症。
出血的症状可以用白头翁、黄连、黄芩，热症比较重，特别是伴有里急后重感的患者加大黄，可以比较快的将肠内的热及时的清出来，特别是缓解患者的里急后重感有着比较好的效果。因为赤痢有肠道出血，所以也要加止血的药物，如芍药汤的使用。
所以治疗原则要进行清肠化湿、调气和血、清热解毒、凉血除积，中药治疗赤痢也应该先辨证确定哪一个症型，然后再考虑进行有效的药物治疗。