慢性结肠炎患者如果病情平稳，经过积极抗炎及对症等治疗，患者的临床症状明显缓解，没有溃疡、穿孔、梗阻等并发症出现时，此时可以进行新冠疫苗的接种，能够增强机体抵御新冠病毒的能力。
但是，如果慢性结肠炎患者病情仍在继续发展、变化，或者并发消化性溃疡穿孔、梗阻、出血等，需要进行系统性的临床治疗或者手术治疗，此时不能进行新冠疫苗的接种。
另外，如果慢性肠炎是由于消化系统的肿瘤导致，或者其他疾病引起的并发症，此时也要避免进行新冠疫苗的接种。