贾第虫病病人用药时，首先要隔离治疗，要注意观察药物的不良反应。其次，要注意观察患者的症状是否有缓解。部分患者口服甲硝唑或者其它的驱虫药物后，有可能会导致患者出现药物的不良反应，比如出现了口腔的金属味、恶心、呕吐、嗜睡等，而且口服药物期间需要禁止抽烟、喝酒。如果有出现明显不适，有可能需要调整用药方案。
在日常生活中，要注意个人的饮食卫生，要加强水源卫生的管理，同时要消灭蟑螂以及苍蝇等传播媒介，做好粪便的无害化处理，对于该疾病的治疗有重要意义。