发生己糖激酶缺乏症的时候，除了要积极地进行对症支持治疗以外，比如病人发生贫血比较严重的时候，血红蛋白浓度低于60克每升，可以进行输血。另外，部分患者还可以考虑使用血浆置换的方法来进行治疗。
饮食方面也非常重要，可以尽量地吃一些清淡的、比较容易消化的食物。比如可以多吃一些新鲜的蔬菜和水果，有助于病人病情恢复。
己糖激酶缺乏症的患者，还可以适当地多吃一些有营养的、富含优质蛋白质的食物。比如鱼、虾、瘦肉、鸡蛋等。
最好是不要吃辛辣、刺激性的食物；也不要吃芒果、菠萝等有可能会引起过敏的食物；不要吃带有刺的，或者是带有骨渣的食物，以免导致病人的症状进一步的加重。