胃肠道间质瘤，一般如果直径小于2cm，这种情况可以考虑定期地进行复查和观察，不必进行手术治疗。临床当中对于胃肠道的间质瘤如果大于2cm，原则上一般可以考虑进行手术治疗。
胃肠道的间质瘤生物学行为一般表现为比较特殊，手术治疗只是针对于病灶进行局部切除，不必进行大范围的淋巴结清扫，一般可以根据术后的病理情况来进行分型和分级。对于风险比较高或者是病理类型比较复杂，也需要进行术后的药物治疗，避免再次复发。
总之，胃肠道的间质瘤可以进行手术，但也要严格地选择手术适应证。