真菌性肠炎的症状主要是大便次数增多，出现许多气泡，大部分粪水发黄、有异味，有的像豆腐渣，有严重化脓性大便或血性化脓性大便，伴有低烧、呕吐、腹痛、腹胀等，发病率很高。
真菌感染性肠炎主要与长期使用抗生素、抗炎药有关，在治疗上最好是提高免疫力和服用抗真菌药物。
建议在医生指导下进行益生菌治疗，患者可以服用双歧杆菌活制剂或益生菌胶囊，此外在治疗的同时，还应该改善清淡饮食和流质易消化饮食的饮食结构。