要区分多囊卵巢综合征和肥胖症，主要要通过以下几个方式：
首先，可以查一下患者的妇科彩超，这是区分二者最根本的检查。一般多囊卵巢综合征的患者，卵巢部位的彩超是会出现异常的，多表现为卵巢表面出现多个液性暗区，并且患者通常伴有不孕，使用一般的方法治疗难以逆转。而肥胖症的患者大多不会存在有妇科彩超的异常。
其次，可以筛查血清激素的水平，对于鉴别二者也有一定的帮助。
最后，可以观察患者的体貌特征，多囊卵巢综合征的患者大多有痤疮、体毛增多等女性雄性激素增多的表现，肥胖症则不会出现。