流行性出血热的辅助检查包括血常规检查：早期白细胞总数正常或者偏低，病程3-4天后会出现白细胞总数的明显增高，而中性粒细胞在早期开始增多，重症患者可以出现类白血病反应。尿常规检查可见蛋白、红细胞、白细胞及管型，最早在病程第2天可以出现蛋白尿,蛋白含量及持续时间与肾脏损害的程度呈正相关。在血生化检查方面,多数患者在休克期及少尿期以代谢性酸中毒为主。血清学和病毒核酸的检测，患者血中特异性的抗体和病毒抗原的检测对本病有确诊的作用。ELISA法测定早期患者特异性的IgM抗体阳性或IgG双份血清滴度4倍以上增高有诊断意义。另外采用RT-PCR等分子生物学方法检测患者血或尿中的病毒核酸,具有特异性强、敏感性高的特点,有助于疾病的早期诊断。