不痛、不痒、也不流脓的肛瘘有可能是处于肛瘘发作间歇期。如果后期不出现反复的肿痛以及流脓症状，可以继续观察而不做特殊处理。
在平时的生活中，要注意清淡饮食，避免辛辣刺激性的食物、避免饮酒、保持排便通畅、防止便秘，便后注意肛门局部清洁卫生，防止肛瘘出现急性感染。
但绝大多数的肛瘘后期还是有可能会因为瘘管内急性感染，而导致局部肿痛以及流脓症状。极少数的患者肛瘘瘘管会出现皮肤化，而不再出现肿痛流脓症状，就不需要特殊的治疗。