慢性结肠炎需要与肠易激综合症、直肠结肠癌或者慢性的阿米巴痢疾等疾病相鉴别。
慢性结肠炎是一种非特异性的炎症感染性疾病，临床表现不是很典型，有可能还需要与细菌性痢疾、肠结核以及血吸虫病等疾病相鉴别。为了明确疾病的诊断，需要到医院就诊，做大便常规电子肠镜，以及肠黏膜组织的病理学检查，排除肠道肿瘤性疾病后，给予用药治疗。可以给患者口服保护胃肠黏膜的药物，以及免疫抑制剂，有利于症状的缓解。
在日常生活中，需要养成良好的生活习惯。