阿米巴结肠炎引发的肺炎，首先是要积极的根据患者的疾病病因，选用药物治疗。因此，需要给患者口服甲硝米唑抗阿米巴治疗。
同时如果反复出现咳嗽咳痰或者，继发细菌感染引发肺炎时，需要及时的加用止咳化痰药物以及抗感染药物治疗，可以促进疾病的恢复。如果有出现大出血、肠穿孔以及转移性脓肿时，还可能需要通过手术治疗。具体的手术方式以及手术路径，要根据个人情况决定。
在日常生活中要注意个人卫生，不饮生水，不吃或者不接触野生动物。