如果是轻度或早期的脑积水，可以用药物进行治疗，但是病情严重时，就需要进行手术。
患者需要在专业的治疗医师指导下使用药物，患者的家长不能自行使用。如果是两周岁以内的患儿，首选抑制脑脊液产生的药物。另外，也可以使用利尿剂，比如甘露醇、呋塞米，还需要使用脱水药物。如果患儿出现蛛网膜粘连的情况，需要给予激素进行控制。
如果存在出现神经症状，可以暂时使用美金刚，进行缓解。还可以进行经前囟或腰椎穿刺，将颅腔内的液体引流出来，减轻压力。如果症状比较严重，非手术治疗效果不明显时，就需要进行手术治疗。