喝菊花茶拉肚子，是因为菊花是一种寒凉性的食物，具有清热、解毒的功能。
假如患者本身就有胃肠道不适，但是没有出现腹泻症状，进食菊花茶后，拉肚子的可能性更大。同时，菊花茶对于患者的胃肠黏膜具有很强的刺激作用，有可能会促进胃肠道的蠕动，而导致患者出现腹泻的症状。因此，有胃肠道不适的患者不建议喝菊花茶，而且一次喝的量也不能太多。
如果拉肚子症状较为严重时，需要及时的使用药物治疗，有可能需要给患者口服止泻药物以及胃肠黏膜保护药物。