亚急性心内膜炎是否需要手术治疗，需要根据心内膜炎的发病阶段，再就是是否引起了瓣膜的狭窄或者关闭不全，是否导致了心脏功能的影响来判断。
如果在亚急性心内膜炎的后期，形成了比较大的赘生物，影响到了瓣膜的狭窄或者关闭不全，这种情况下，就需要进行瓣膜置换。如果心内膜炎造成了瓣膜的损害，像瓣膜的穿孔，也必须要通过手术修补的方法来改善。
再就是严重的瓣膜感染通过药物治疗不能控制，这种情况下也需要进行手术治疗，切除严重感染的瓣膜。反之，如果是亚急性心内膜炎的急性期，这种情况下，一般首选的方法是药物保守治疗，也就是选择敏感的抗菌素，来控制感染。