患有胃肠道间质瘤后可以进行艾灸，但是只能够起到辅助治疗的作用，而且在艾灸时一定要寻求中医师帮助，选择正确的穴位缓解不适症状。
患有胃肠道间质瘤后，单纯的通过药物治疗作用效果也不明显，需要及时进行手术治疗，手术后取出肿瘤送病理化验，然后根据患者体质状况及病理分析决定治疗方法。
如果是良性的胃肠道间质瘤，手术后绝大多数不会复发。如果是恶性的胃肠道间质瘤，需要根据浸润程度、转移方式决定是否需要进行其他部位治疗。