咽喉肿痛、发热处理通常为消炎、杀菌处理，但是需要明确感染细菌类型，才能针对性使用药物。
咽喉肿痛发热，通常都是细菌病毒感染导致的，对于目前无法明确感染细菌类别者。可先使用广谱抗生素治疗，如头孢拉定、阿莫西林等。如果经痰细菌培养后明确为支原体、衣原体感染导致的，可以使用大环内酯类抗生素，如罗红霉素、阿奇霉素等。
如果疼痛明显，体温超过38.5℃者，需要使用非甾体抗炎药进行止痛退热治疗。如果高烧持续不退，则需要注射少量糖皮质激素治疗。