反流性肾病的症状主要包括尿路感染症状、蛋白尿、高血压以及夜尿增多、多尿等症状。尿路感染是反流性肾病患者最常见的临床表现，一般感染发作在新生儿常表现为发热和生长发育的缓慢。较大年龄病孩以及成年人常有尿急、尿痛和尿频等症状，严重的患者还会表现为典型的急性肾盂肾炎。
蛋白尿是预测反流性肾病患者预后最重要的指标，可为反流性肾病的首发症状，也可在严重瘢痕形成数年之后才出现。反流性肾病患者早期的少量蛋白尿多为尿路感染所导致，一般尿蛋白常2.0g/d,甚至为肾病综合征范围的蛋白尿，是预后不良的标志。
此外，高血压也是反流性肾病患者后期的常见并发症,也是儿童恶性高血压最常见的一个病因。随着肾瘢痕的进展，肾素-血管紧张素产生过多,合并高血压的危险性更大。而夜尿增多、多尿等是临床上反流性肾病患者较常见的临床表现。由于膀胱输尿管反流患者远曲小管最先受影响，因此患者会出现夜尿、多尿等尿液浓缩功能异常的表现，是反映肾功能损害的敏感指标。