慢性结肠炎可以口服补脾的中成药并且联合益生菌类的药物缓解症状。从中医的角度，慢性结肠炎属于一种脾虚的表现，可以口服上述药物缓解。从西医的角度，慢性结肠炎是一种炎症感染性疾病，因此抗感染治疗是该疾病的治疗关键。
如果患者症状较为严重并且有出现脓毒血症、败血症等疾病时，也可能需要联合使用糖皮质激素抗炎治疗，促进疾病的缓解，挽救患者的生命。
在使用药物治疗的同时，也需要患者养成良好的生活习惯并且要有良好的心态。