阿米巴肝脓肿的治疗，主要的治疗措施是使用抗阿米巴的药物，严重的有可能需要给予外科手术治疗。
临床当中比较常用的药物有甲硝唑、氯喹等药物，具体药物的用法用量根据医嘱执行。
如果脓肿较大，并且出现压迫症状时，也可以穿刺抽脓以及引流，但是在引流过程当中需要严格遵循无菌的操作原则，每次尽量吸进脓液。
如果有混合感染，在脓液吸尽后可以注入抗生素治疗，必要时可以做细菌培养以及药物的敏感试验，根据药物的敏感试验，选择敏感的抗生素治疗。