胃食管反流病有可能会损伤肺部，因为胃内的反流物有可能会误吸至肺部，导致患者出现吸入性的肺炎，也可能会导致患者出现咽喉部的不适。
如果有胃食管反流病的患者反复出现咳嗽、咳痰，并且使用了抗炎药物以及止咳化痰药物，症状没有明显改善时，应该要及时地到医院就诊，并且考虑有吸入性肺炎的可能。
可以适当地给患者服用抑制胃酸分泌的药物，促进胃肠道蠕动的药物，观察患者的咳嗽、咳痰症状是否有改善。同时，也有可能需要给患者服用抗炎药物。