真菌性食管炎可以吃伊曲康唑这种药物来治疗。真菌性食管炎主要的原因是受到了真菌的感染，因此，在治疗方面，主要是合理选择抗真菌药物是该疾病治疗的核心。
同时，伊曲康唑也属于一种抗真菌的药物。在使用抗真菌药物治疗的过程当中，需要注意观察药物的不良反应，特别是肝功能的损伤，也可能会损伤患者的胃黏膜。因此，还可能需要给患者使用胃黏膜的保护药物，有利于改善局部的卫生循环，促进黏膜的修复。
如果有继发细菌感染，还需要及时给患者使用抗感染药物治疗。