金樱子有固精缩尿、涩肠止泻的功效。
金樱子性酸涩收敛，专功收涩，其入肾、膀胱、大肠经，所以适用于下焦不固引起的诸多病症，尤其是对肾虚遗精、遗尿，女性白带过多，以及脾肾虚导致的久泻、久痢有很好的治疗作用。现代药理学研究，金樱子能促进胃液分泌，减少肠液分泌，煎煮后的汤剂能抑制金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、绿脓杆菌以及钩端螺旋体等。另外还有报道，金樱子的浓缩液内服对子宫脱垂也有很好的疗效。
金樱子多用于慢性泻下，不适合湿热遗泻、急性泻痢，容易闭门留寇。