肛瘘手术后饮食需要注意手术后的当天最好吃流质的食物，少量多次进食，不要食用过多，避免排便时对伤口造成刺激，引起出血，容易引起感染。
术后三天根据伤口的恢复情况，可以逐渐吃半流质的饮食，慢慢过渡到正常饮食，但是要避免吃辛辣、刺激的食物，如辣椒、生姜、大蒜等。可以多吃膳食纤维丰富的蔬菜水果，不要吃鱼、虾、蟹等发物，也不要吃油炸、熏烤、烧烤类的食物。
如果属于复杂性的高位肛瘘，由于术后创伤面较大，可以适当补充一些优质蛋白的食物，有利于创面的愈合，比如瘦肉、牛奶、鸡蛋等。