肛瘘手术后由于形成了开放性的创面，饮食需注意，手术当天的饮食要吃流质的食物，避免出现排便刺激伤口导致伤口出血。
术后三天左右可以吃流质的食物，并要少量多次进食，可选择维生素丰富的瓜果蔬菜进食，保持大便的软化通畅，避免出现便秘，排便过度用力刺激伤口。也不可以吃辛辣刺激性的食物，因为这些食物会刺激伤口，引起局部出现炎症，不利于伤口的恢复。
辛辣刺激性的食物还会容易引起腹泻，加重局部感染的几率。每次便后要清洗肛门、勤换内裤。