肩胛区疼痛常见原因为肩胛局部骨骼或软组织损伤引起，或脏器疾病反射至肩背部，还有其它部位肿瘤转移至肩背部引起疼痛。
持续性剧烈疼痛常见于肩关节骨折、脱位引起，有明确外伤史。肩部牵涉痛常见于内脏疾病或痛觉过敏等，此种疼痛出现较缓慢，有钝痛感，痛感区域模糊。
肩胛区弥散的钝痛及放射性痛，见于颈椎神经及胸椎神经卡压引起。肩周酸痛、不适，常见于肩关节周围炎，同时有肩关节活动范围下降。长时间保持低头坐位的姿势，会引起肩胛区肌肉、筋膜慢性劳损，而引发肌筋膜炎产生疼痛。