十二指肠结核主要并发症为肠梗阻、肠穿孔、腹膜炎、肠粘连、肠套叠和收缩性憩室。十二指肠结核主要是继发于肺结核，或由体内结核感染引起。发病以青壮年为主，患者有肺结核接触史，或长期与家人慢性接触，甚至自身患有肺结核。有些病人有特殊的消化道反应，通过腹部平片，可能会发现右下腹肠梗阻，甚至有胀气表现。
结肠镜下可见回盲部严重狭窄、溃疡或炎症，同时结合病理检查，可作出诊断。除此之外，结核菌素试验可以鉴别，也可以根据临床诊断性治疗的有效性来诊断。