慢性间质性肾炎往往起病比较隐匿，另外病理类型往往是以肾间质纤维化，肾间质单个核细胞浸润和肾小管萎缩为主要特征发生的原因。
感染因素占主导地位，细菌真菌以及病毒感染，尤其是金黄色葡萄球菌引起来的败血症，重症链球菌感染，白喉杆菌感染，猩红热，梅毒杆菌病，肝病毒感染都有可能会引起间质性肾炎，再就是系统性疾病，比如系统性红斑狼疮，干燥综合症，结节病，原发性冷球蛋白血症，血液系统疾病，多发性骨髓瘤症，多发性血红蛋白尿都有可能会导致慢性间质性肾炎，另外重金属中毒，比如说铬中毒、锂中毒，再就是一些化学毒物，比如乙二醇、甲醛，还有一些毒物比如蛇毒、蜂毒也有可能会导致慢性间质性肾炎。