咳铁锈色痰有可能是因为寄生虫引起的，临床上主要是指卫氏并殖吸虫引起的相关疾病，患有该疾病的患者多有在流行区生食或者半生食溪蟹类、喇咕类、沼虾类或生饮溪水，咳铁锈色痰，伴乏力、食欲不振、腹痛、腹泻、游走性皮下结节或肿块等，考虑卫氏并殖吸虫病的可能。
除此之外，铁锈色痰主要是大叶性肺炎常见的临床表现之一，这是因为大叶性肺炎时，肺泡毛细血管会扩张，充血，肺泡内渗出的红细胞在破坏后，会释放出含铁血红素混于痰中，故而出现铁锈色痰。如果是卫氏并殖吸虫病，一般通过皮下结节或肿块的活检即可确诊。